L'ensemble du dispositif de recherche bourguignon mobilise 4.000 personnes dont 1.500 dans le secteur public. La recherche publique se concentre surtout à l'Université de Bourgogne (implantée principalement à Dijon, mais également à Nevers, Chalon-sur-Saône, Le Creusot et Auxerre), dans les laboratoires des grands établissements de recherche (CEA, INRA, CNRS, INSERM) et à l'ENSAM de Cluny.

A l'est de Dijon, l'espace régional de l'innovation et de l'entrepreneuriat (ERIE) hébergera les principaux acteurs du réseau régional de l'innovation et du développement technologique.

Quatre entreprises bourguignonnes ont été récompensées pour leurs actions en matière d'innovation, jeudi 26 novembre, dans le cadre du salon Entreprissimo.

Après l'année Vauban en 2007, le conseil régional est aujourd'hui partenaire principal de l'opération Cluny 2010 qui célèbre, une année durant, le 1100e anniversaire de la  fondation de l'abbaye de Cluny. Expositions, spectacles équestres, mais aussi soutien au programme de recherche Gunzo  et restauration du patrimoine bâti, l'objectif est clair : renforcer l'attractivité de Cluny et la faire rayonner au cœur de l'Europe.

En complément du Plan régional de soutien à l'économie, un plan d'actions régional pour l'innovation (PARI) est lancé. Objectif : stimuler l'innovation par la recherche et dans les entreprises. Le PARI, doté de 10 millions d'euros, a été adopté le 29 juin 2009.

Dijon a vu la naissance, en 2007, du GIS AGRALE, soutenu par le conseil régional de Bourgogne, destiné a renforcer et promouvoir le pôle d'enseignement supérieur "Agri Agro" (Agricole et agroalimentaire).

UB Filiale, structure de développement technologique rattachée à l'université, assure depuis le 1er janvier 2008 une mission d'interface entre chercheurs et monde industriel. Un maillon essentiel dans la chaîne de la valorisation de la recherche bourguignonne et le transfert de technologie, soutenu par le conseil régional de Bourgogne.

Le conseil régional de Bourgogne, en charge de l'enseignement supérieur, la recherche et l'innovation, a installé, jeudi 22 novembre 2007, à l'hôtel de Région, le Conseil de la science pour la Bourgogne.

L'INRA disposera bientôt d'un nouveau plateau technique à Dijon. Un équipement ultra-performant pour une recherche coopérative unique en France.